Višji začetni stroški: V primerjavi s tradicionalnimi strešnimi sončnimi kolektorji imajo solarni strešniki pogosto višje začetne naložbene stroške.
Rahlo nižja energetska učinkovitost: Običajno je učinkovitost pretvorbe energije solarnih strešnikov lahko nekoliko nižja kot pri standardnih solarnih modulih.
Pomanjkanje storitev namestitve: Trenutno je razmeroma malo podjetij, ki ponujajo storitve namestitve solarnih strešnikov, kar lahko povzroči nekaj nevšečnosti med postopkom namestitve.
